En 2001, a été inauguré un vaste espace souterrain consacré à l'Egypte pharaonique. Y ont trouvé place les reconstitutions grandeur nature de deux tombes égyptiennes, celles du maire de Thèbes, Sennefer (vers 1420 avant J-C.).et celle de la reine Nofretari, épouse de Ramsès II (vers 1230 avant J-C).
Cette évocation des "demeures d'éternité" est complétée par les collections archéologiques regroupant un mobilier à caractère funéraire tels que sarcophages, momie, vase canope et oucheptis, modèles de barque et de laboureur et divers objets de la vie égyptienne.